脑部ct和磁共振检查的主要区别是检查的原理不同。ct检查主要是通过x射线对脑部扫描，观察脑部结构的形态以及密度，以此来判断是否有异常情况发生。而磁共振检查，主要是利用磁场和射频脉冲进行成像，观察脑组织所发生的病变，进而诊断疾病。
如果患者有严重的脑外伤时，到医院就诊时，通常医生会建议先做脑部ct，可以快速诊断患者脑内的具体情况，了解是否有脑挫伤、硬膜下血肿、颅骨骨折等情况。如果是脑血管疾病的患者到医院就诊，通常建议选择做核磁共振检查，排除脑内是否发生有新的梗塞病灶。